为了避免重茬带来的大量土传病害，生产上一般西瓜苗都使用嫁接技术，嫁接后的管理是西瓜苗成活的关键。
嫁接后的管理
①保温 嫁接后前3天棚内温度白天28~30℃，夜温20℃左右；3天后苗床温度保持白天26~28℃，夜间17~18℃；一周后嫁接苗基本愈合，进行低温炼苗，白天温度25℃，夜间温度15℃，10天后按普通苗床进行温度管理。
②保湿 嫁接苗置于苗床后应浇透底水，密闭拱棚2~3天，保持棚内空气湿度在95％以上。约一周后嫁接苗基本成活，可按正常苗进行湿度管理。
③光照管理 嫁接后苗床用遮光物覆盖，防止植株因高温蒸腾过强而引起萎蔫，3天后可早、晚揭去遮光物，之后视苗情逐渐增加光照，延长见光时间，先是散射光、侧面光，逐渐增加见光量，1周后可以完全撤去遮光物。
④通风换气 嫁接后头两天，苗床需保温保湿，不能通风；3天后早上、傍晚可揭开薄膜两头换气1~2次；5天后嫁接苗新叶开始生长，应逐渐增加通风量；一周后嫁接苗基本成活，可按一般苗床进行管理；20天后可以定植到大田，定植前应炼苗3~5天，防止嫁接苗徒长，使嫁接苗适应定植环境。
⑤嫁接苗成活后的管理 砧木切除生长点后，若仍有侧芽陆续萌发，应及时抹除，以防消耗苗体养分，影响接穗的正常生长。抹芽动作要轻，以免损伤子叶和松动接穗。应根据嫁接苗成活和生长状况，进行分级排放，分别管理，使秧苗生长整齐一致，提高好苗率。一般插接苗接后10~12天，靠接苗接后8~10天，即可判定成活与否。靠接苗成活后，即可切断接穗接口下的接穗幼茎。为防止断茎过早而引起接穗凋萎，可先做少量断茎试验，当确认嫁接苗完全成活后，再进行全部断茎。取下嫁接夹收存，以备再用。
