随着微生态学的发展，微生态制剂这个名词也深入人心，比方说我们经常喝的酸奶，这个也属于微生态制剂。随着整个微生态学的发展，微生态制剂作为一种新型的特种生物制剂受到了关注，中国农业大学植物保护学院植物病理学系王琦教授对此深有研究，这种新型的生物制剂是怎么研发出来的呢？
微生态制剂的理论指导是微生态学，在植物微生态学发展历程当中，有两个重量级人物，一个是中国农大的陈延熙教授，1980年就提出了植物体自然生态系理论，一颗植株除了植物学讲的是由细胞组织，器官和系统之外，还有微生物，所以这就对微生物在认识上有了一个很大的进步。另一个是中国农大的梅汝鸿教授，奠定了植物微生态学，带领团队研发出了第一个微生态制剂。
植物微生态制剂是怎样研发出来的呢？
第一步，找健康植株。要在发病重的地里找健康植株，发病重的地里绝大多数还有健康植株，从研究的结果看，它整个植物体表体内的有益微生物的量还是比较高的，如果它没有这么高的量，它也健康不了。所以呢，这个健康植株的找法不一样。
第二步，进行微生物的培养。我们把它叫做微生态系统的微生物，为什么叫微生物生态系统的微生物？因为它是植物体表体态的微生物。这个微生物的优势表现在，与植物的关系非常密切，很容易做成生物制剂运用到农作物上，且很容易进入到农作物体表体内，这样它发挥作用的效率就更高了，所以微生态系微生物有它的特殊性。
现在很多生物制剂，可能受环境条件影响比较大，但是微生态系微生物受环境条件的影响相对比较小，因为它跟植物形成了一个紧密的关系。我们都知道海南岛能种水稻，黑龙江也能种水稻，从大的气候条件来说，这两个地方的气候差异还是非常大的，但是从他的水稻外环境来说，差异就小多了。所以微生态系微生物，只要跟农作物介入关系进入到体表体内，它受环境的影响就比较小了。
第三步，做有益微生物的筛选。怎么筛选？首先是筛选有促生和增产功能的微生物，有了促生和增产功能之后，再在这些微生物里面筛选具有其他有益功能的微生物，这样就保证微生物制剂至少有两样功能，一个是促生增产，这个是最基本的。再一个就是防病抗逆。这样的话，农民用了这种生物制剂就能明显看到效果，假如只有防病功能，不发病的话，农民就觉得亏了，这样的话用和不用区别不大，因为农作物发病不发病的影响因素太多了。但是用了这个生物制剂，作物即使不发病，还有促生增产的效果，整个的筛选有独特的优点。
第四步，做作用机理的研究。做了发酵和制剂加工，最后开发成了微生态制剂。微生态制剂是一种新型的生物制剂，为什么新型呢？它有一个特别的要求，就是微生物菌种来源于植物的微生态系统，所以把它加工成生物制剂，后面的跟普通的微生物制剂没有太多的区别。
第五步，微生态制剂研制思路。我们研究的有益微生物就是微生态系有益微生物，具有促生增产防病的这些有益微生物。它的作用主要有：1.定殖与微生态调控；2.重寄生作用；3.产生抗菌物质（有一些微生物在代谢过程中也产生一些抗菌物质）；4.诱导植物提高抗病性。
现在的微生态制剂以液体发酵为主，为什么呢？
现在的液体发酵整个生产比较好安排，而且木霉液体发酵可以产生厚垣孢子，而且量比较大。固体发酵过程中，它的复合孢子产量确实高，但是从产品开发上更希望有厚垣孢子。所以制剂上，我们也是水剂，粉剂颗粒剂等加工制备。
